戦闘に参加する分隊の編成や、スキルの発動範囲を確認することができます。
分隊のリーダーは指定することができ、リーダーに指定されたキャラクターは
ボーナス経験値を獲得することができます。
ターン制の戦闘システムです。
キャラクター毎に行動力が異なり、APが10以上になったキャラクターから戦闘を開始することができます。
戦闘中には、各種スキルの発動や陣形の変更などが可能です。
記録物保管所では、キャラクター図鑑の確認や、過去にプレイしたストーリーの閲覧などができます。
倉庫では、所持している「戦闘員」や「装備」、「消耗品」を確認することができます。
「部品」、「電力」、「栄養」と「遺伝子の種」を消費することで、新たなバイオロイドを製作することができます。
それぞれの資源の投入量によって製作されるバイオロイドのタイプや等級の確率が異なります。
「急速完成回路」を使用すると製造を即時完了させることもできます。
「強化ポイント」と「強化モジュール」または「使用していない戦闘員」を材料にして、
戦闘員の能力値を上昇させることができます。
「強化ポイント」はキャラクターのレベルが上がると獲得できます。
「部品」、「電力」、「栄養」と「戦闘装備コア」を消費することで新たな装備を製作することができます。
それぞれの資源の投入量によって製作される装備のタイプや等級の確率が異なります。
「急速完成回路」を使用すると製造を即時完了させることもできます。
各種資源と、「強化用チップセット」または「使用していない装備」を材料にして
装備の能力値を上昇させることができます。
各種資源を使用し、戦闘によって中破もしくは戦闘不能になったバイオロイドを修復することができます。
「修復ナノマシン」を使用して即時に修復を完了させることも可能です。
使用していないキャラクターや装備を分解し、資源や各種モジュールを獲得することができます。
昇級では、レベルと好感度がMAX状態のキャラクターの階級を一段階UPさせることができます。
SS等級まで上昇させると、昇級専用スキンが獲得できます。
ロボット設計を進めると、メカニック製作で製作出来るロボットが増加します。
ロボット設計には資源および各種パーツが必要です。
研究条件を満たし、資源およびモジュール等のアイテムを使用すると、
各種施設やシステムを研究することができます。
施設研究をおこなうと、資源回復力が増加する等、ゲーム進行が有利になります。